我在中研院的日子

生日派對聽起來是個再普通也不過的節目了，不過這次的跟平常有點不太一樣。相片中的主角壽星，我們都叫他「Ay」，就是跟隨便叫一個路人「ㄟ！ㄟ！」的那個發音一模一樣，他是今年初才從美國來這裡的泰國籍博士後研究(post-doctor)，因為他的泰國名字發音太複雜，所以大家都簡稱Ay。Ay相當幽默風趣，為人也和善，所以短短的相處時間就跟大夥大成一片。
如果只有唱歌和切蛋糕那就顯不出中研院基因體中心慶生會的特別，所以多才多藝的Christine當場show出了她的拿手覺活--折氣球。老實說，這個聽起來好像很簡單的把戲著實替這場慶生會增添了不少趣味跟色彩，其中一部份氣球成了壽星的項鍊，有的折成了愛心掛在牆上，有的折成了Ay的名字，當還有些折成不相干的動物和物品... 最後最後還要感謝Ay的「神秘女友MS小姐」，從美國越洋訂了兩個美味的提拉米蘇蛋糕，然後再加上我的polaroid相片之後，交織成了一個溫馨又特別的慶生會。
拍攝相機：Polaroid SLR690
使用底片：Polaroid 600 film
拍攝地點：中研院基因體中心

就在這個月，2006年諾貝爾的六個獎項都已經順利產生並公布了，此六個獎項分別為「物理」、「化學」、「醫學」、「文學」、「和平」與「經濟」。儘管每一年公布的得獎者都是當年度最優秀的研究學者或是對全人類極有貢獻的人物，但是好像都跟我們的距離非常遙遠，也就是那種聽到了之後只會很敷衍的說：「哇！好厲害」之類的反應。
2006諾貝爾醫學獎的得主：Andrew Z. Fire與Craig C. Mello

不過這次的獎項當中，我對醫學獎的反應除了敬佩之外還更多對得獎主題的認識，主要是這兩位來自美國(前者是Stanford University、後者是University of Massachusetts Medical School)的學者所研究的領域正好與我現在的研究相關呢！(得獎的題目是"RNA interference - gene silencing by double-stranded RNA")
我想我不會在這裡花一堆篇幅跟大家解釋什麼是RNAi(RNA干擾機制)，也不會說明這個機制的發現對醫學上面的貢獻(其實貢獻真的很大)，有興趣想進一步瞭解的人可以自行連到諾貝爾獎官方網站，或是在Google輸入RNAi(我已經幫各位輸入好了，點這個連結即可)，你將會得到更豐富完整的資訊。
這個獎項的公布對我最重要的兩個意義是：

1. 我在中研院從事的研究是目前炙手可熱的研究領域喔~ (露出沾沾自喜的表情)

2. 當下次有人問我在中研院做什麼的時候，我不用在花太多時間解釋，可以直接告訴他們：「沒什麼，就跟2006諾貝爾醫學獎的內容差不多啦！」 

這是我生平第一次參加"老闆"的婚禮，相信跟我一起在中研院工作的同事們應該也是吧！
實驗室的同事們與新人的合照
因為喜歡拍照的關係，所以有幸擔任這次的攝影工作，不過此次的重點放在DV上面，照片的部分就僅使用了攜帶方便的隨身小傻瓜(Pentax espio mini)來拍囉～ 更多的相片請各位移駕到我的相簿去觀賞，謝謝！

勞退新制終於在今年七月正式上路實施，全國大多數非公務人員的受薪階級皆可受惠，不過在中研院服國防役的我們，到底可不可以是用這項新措施呢？
一般人可能比較不瞭解的是，任職於中研院的研究助理是屬於約聘性質，雖然中研院的編制內人員是納入公務人員的範疇，但是約聘雇人員並不包括在內(公職人員需經過過國家考試合格)，所以當初院內有一套"離職儲金"的條款，約聘僱人員給個月從薪資裡面提撥6%到指定戶頭，而院方也會提撥相同金額。等到離職的時候，員工可以將這筆錢領回，以此方式來達到類似退休金的目的。
不過本來的這項美意在"勞退新制"實施後就變得複雜了，因為"勞退新制"也規定了類似的作法：雇主必需提撥員工薪水中至少6%的金額(這跟原來的"離職儲金"規定一樣，甚至更好)，而員工可以選擇每個月提撥的比例，最高達6%(這就不太一樣)。
當院內發函要我們選擇的時候，一時間真讓人煩惱該如何做決定...
仔細想想，這兩個制度對我們而言最大的差別在於兩點，一個是"離職儲金"可以在離職的時候拿回，也就是說國防役滿四年之後就可領到這筆錢，但是選"勞退新制"的話必須等到工作滿15年或是60歲退休時才可以領回。第二個是政府為了鼓勵勞工選擇"勞退新制"給予自己提撥金的免稅優惠，也就是說我們若選擇月提薪資6%的話，這些金額將不會併入年所得來計算。
以第一個考量來說，"離職儲金"比較佔優勢，因為拿回的錢可以自己運用(選擇更好的投資理財工具)，獲利應該比3%利息(退休金)要高，而且目前的政府的財務狀況並不理想(執政黨不擅經濟)，使得許多人都不相信政府的執行能力(真是可悲的事實)。
若排除上述的政治因素，純粹以個人理財的角度來看，"勞退新制"提供了提撥金額免稅與至少3%的利息來說，算是非常優厚且吸引人的條件。

在國外許多公營機關為了敦親睦鄰或讓大眾瞭解該單位的運作情況都會定期舉行所謂"Open House Day"(開放參觀日)的活動。中研院身為全國最高學術研究單位，也需要搞一個類似的活動讓一般民眾有機會一窺究竟。Open House Day通常都會規劃在假日時間，大家才會有空來參觀，所以本來這樣的活動跟我們這種國防役的研究助理應該扯不上關係(我們只是個朝九晚五的上班族)，而且去年在資訊所的時候就是這樣，但是今年有所不同，主要是在我的工作地點調到了"目前中研院最新落成的大樓"--基因體與蛋白質研究中心(當然還有許多建築正在興建)之後，這一棟外觀特別(由鋼骨與玻璃帷幕形成的現代感)、別具時代意義(基因與蛋白質是目前頗熱門研究題目)的大樓就成了大家期待參觀的重點之一。
在基因體中心wet-lab的走廊隨拍
基因體中心內部除了行政區域之外，研究室主要分為兩個區塊，一邊是所謂的dry-Lab，當作研究員辦公室或是不用作生物的實驗的研究室，另一邊則是俗稱的wet-lab，劃分給需要做生物實驗用。一棟諾大的研究實驗大樓當然不能隨便開放了事，當民眾來參觀時必須要有部分人員駐守(通常是抽籤決定)，一方面負責介紹解說，一方面也可以看管實驗室的財物。而我剛好就是運氣很被的那一位，需要在星期六的早上來這裡加班。
玻璃帷幕的外觀，很顯眼的造型
一樓入口旁有一個大型圓柱狀的結構，裡面是演講大廳
帷幕玻璃的好處就是視野非常好，下班時分還可以遠眺台北101(這一張是失焦版的101 :P)

老闆這個星期出國參加研討會，雖然臨走之前有交代許多工作，但是沒有人盯著的時間還是令人覺得格外輕鬆。而這幾天的天空好像也能體會我的感受，晴朗的不得了呢！
(相片中咖啡色的建築是離中研院大門口最近的生醫所)
出過國遊玩之後就一直覺得台灣的天空總是灰濛濛的，儘管是在天氣好的日子，空氣中也會瀰漫著一股淡淡的薄霧(嚴格說起來應該是空氣中的微粒)，拍出來的顏色不但不夠鮮豔，也少了一種透明感。但是這幾天的台北卻有了大大的改變，不知道是何原因，空氣突然變得乾淨了起來，使得陽光也變得特別耀眼，實在是難得一件的景象。有這樣好的天氣，要不是我的責任感作祟，我一定會帶著相機蹺班拍照去了。
因此我還是只能乖乖地待在實驗室，等到傍晚時分才跑到樓頂來個黃昏搶拍，幸好這時的光線非常柔和，在景色不甚優美的中央研究院裡拍了一些美麗相片。
(面對東方的汐止山邊拍一張)
(跟上一章同樣角度，但是光線不同)
(華麗的大樓上面居然有簡陋的電視天線!?)
(直接面對露出雲層的夕陽，果然測光失敗)
(這就是我們中研院裡的招牌玻璃帷幕大樓)

雖然micro RNA(通常縮寫成miRNA)功能的新發現不如當時Watson與Crick發現DNA就是遺傳物質時那麼地震撼，但是這個微小卻擁有重要功能的東西，一下子就擄獲許多研究學者的目光，自2002年開始，有關miRNA的學術論文與新知文章就像驚蟄後的昆蟲動物似的，通通出籠。
在轉換到基因體中心工作後的第一件工作就是針對miRNA的相關問題做調查，而老闆每次在meeting時都會抽問我一次：「請用一分鐘簡單介紹什麼是miRNA？」如果稍稍對分子生物學有一點點概念的人都知道所謂的"中央信條(central dogma)"，也就是DNA-->RNA-->Protein這樣的順序(細胞核內的DNA將基因資訊轉錄到RNA上，RNA再將資訊帶出細胞核，並在細胞質中將基因基因轉譯成各種不同功能的蛋白質Protein)。若我們再仔細地觀察的話，從DNA轉錄出來的RNA並不是都轉譯成了蛋白質，而是另有用途喔～
通常我們稱會轉譯產生蛋白質的RNA為coding RNA(因為上面含有生命的密碼嘛)，相對地，不會產生蛋白質的RNA就稱為non-coding RNA，而miRNA就是其中一種。之所以被稱為micro的原因就是他的長度非常短，大約只有22個nuleotide，他的特殊排列順序會跟mRNA(coding RNA)的一部份結合，進而抑制蛋白質的生產，達到調控基因表現的目的。
有關miRNA的生成過程就比較複雜一點(但也不算很複雜)，上面的圖已經詳細地描述出miRNA的起源與功能(從右下角開始，左下角結束)，有興趣的人可以利用google的強大搜尋系統去做更深入的瞭解囉...

從年初就已經談好的轉換實驗室計畫，終於在今天完成了，新的工作地點位在基因體中心(也是新的大樓，目前有許多地方都還在施工階段)，新的實驗室三面都有落地窗，所以採光相當良好，而我的位址也在一面落地窗的旁邊，所以算是個很不錯的座位喔~
相片中被堆滿棒球用具的地方就是我的座位，還是個靠窗的邊間呢！看起來還不賴。
剛到一個新實驗室的必備工作不外乎就是整理環境、適應工作模式與認識新同事三件事，適應能力還算不錯的我本來還能得心應手，但是這次的研究內容轉變實在有點大(從純資訊理論-->生物資訊)，再加上準備結婚的各項瑣事，讓我這一週都過得渾渾噩噩，不太能夠掌握生活的節奏。好在新的同事們都相當熱情與好相處，使得我在忙亂的情形下還是能維持不錯的心情來面對一切新事物。

從今天開始為了申請轉換實驗室(從演算法轉到生物資訊領域)作準備，我先到未來要去的實驗室去參加group meeting。Meeting的地點就在新落成的基因體中心二樓，一進到基因體中心大樓，突然有種說不出的清新感覺，除了設備與裝潢皆與資訊所破舊狹小的感覺有極大落差之外，這裡空間中的電磁波好像也比資訊所少了許多(因為資訊所的電腦密度非常之高)，使得整個人變得健康起來。
這次的報告內容是由一位"波斯大"(英文為post-doctor，博士後研究人員的稱呼)所準備的，題目是有關蝙蝠的視覺。這個題目一聽就知道應該比較與生物相關，資訊的成分極少，而聽完了之後也發現確實如此，報告內容大概有1/3是我的理解範圍之外，尤其是提到許多生物常用的專有名詞。看來我以後的工作就要常常跟這些念起來很饒舌(若把這些字母放在歌詞裡面，應該也會難倒那些RAP歌手吧~)的拉丁字母作伴了。
摒除學術研究的部分，今天的meeting到比較像看了兩個小時Discovery頻道，原來大部分的生物能分辨的顏色(嚴格來說應該是視蛋白opsin能感應的光波範圍)並沒有人類(靈長目)這麼多，我們都知道人類的眼睛構造可以分辨"藍"、"綠"與"紅"，而其他的哺乳綱動物接只能分辨兩種"藍"與"紅"。
蝙蝠在生物分類上也是屬於哺乳綱，但是有一大部分的蝙蝠(micro-bat)生活的環境是沒有光線的，飛行或捕食的時候靠得是獨特鼻腔發展的聲納定位系統(echolocation)，根據物競天擇的理論，在不需要辨別顏色(僅需要辨別光線明亮)的生存環境中，蝙蝠的辨色能力是否跟著退化了呢？(如上圖)
答案竟然是否定的(這個研究成果已經發表在學術期刊上)！蝙蝠的辨色能力除了可以看見紅色(精細度比人類還高)之外，還可以看得見紫外光，這個令人驚訝的發現目前還沒有太多的研究可以解釋呢！

每次被介紹我正在讀博士班的時候，對方的第一個問題就是「你在從事哪一方面的研究呢？」然而當我說出"平行與分散式的容錯處理"時，大部分非本科系的人都會一頭霧水的看著我，似乎覺得我亂掰了一個聽不懂的名詞搪塞他們。事實上念到博士班之後，研究的範圍都變得比較狹窄與專精，而我目前的情況真的是有點專過了頭，幾乎跨越到數學的領域，把自己搞得一個頭兩個大。
數學是電腦的基礎，當我們遇到一些理論性的證明時，數學就是最後能使用的工具，而且通常不是很高深的數學，大概是高中程度就可以了。偏偏我的數學在國中時代就被我玩掉了(真佩服我當時的爛數學還敢念理工科)，所以louise和google就變成了我的最佳顧問。
"地圖著色問題"是個典型的數學與電腦結合的例子，早在1852年，有一個英國青年人叫法蘭西斯.古特理(Francus Guthrie)在為地圖著色時發現了一個有趣的現象，假定在地圖上每一個相鄰國家必須用不同的顏色，竟然只要四種顏色就可完成著色。這個看似直覺又簡單的問題，困擾了許多後來的數學家(如：狄摩根(De Morgan)與凱利(Cayley)等大師)。
仔細想想這個問題還真不簡單，先後有人宣稱發現了證明，而後又被其他人找出了漏洞，也有人退而求其次，證明五個顏色可以完成(當然也是一項偉大成就)...直到1976年伊利諾大學教授阿貝勒(Appel)和哈根(Haken)兩人利用高速電子計算機，計算出了四色定理是正確的，這個百年問題才在這裡劃下了句點。
上面的敘述跟我的研究有何關係呢？我個人覺得「有」，因為我目前遇到了一個棘手的問題也有類似的性質(不過難度應該小多了)，看似直覺的結果，卻遲遲無法找到有力的證明方式，只好繼續寫著一疊疊的計算紙，希望哪一天奇蹟出現，讓我破解這個難題吧！